รูโรนิ เคนชิน ซามูไรพเนจร เรื่องราวเกิดขึ้นในสมัยเมจิ ซึ่งระบอบศักดินาของญี่ปุ่นล่มสลาย เคนชิน ฮิมุระ (ทาเครุ ซาโต้) ชายหนุ่มพเนจร ผู้มีอดีตเคยเป็นนักฆ่าผู้โด่งดังนามว่า ฮิโตคิริ บัตโตะไซ ภายหลังจากสงครามสิ้นสุดลง เขาเดินทางร่อนเร่ไปยังเมืองต่างๆตามชนบท เสนอตัวที่จะใช้ทักษะของเขาในการปกป้องผู้คน เพื่อเป็นการไถ่บาปให้กับหลายชีวิตที่เขาเคยฆ่า และปฏิญาณกับตนเองว่า จะไม่มีทางคร่าชีวิตผู้อื่นอีก แต่เมื่อบรรดาผู้คนที่เขารักถูกทำร้ายและทรมาน เคนชินต้องเลือกว่า จะยอมเผชิญหน้ากับอดีตอันดำมืดของตนเพื่อช่วยเหลือผู้คนเหล่านั้นหรือไม่ Rurouni Kenshin